Universiteit Leiden

nl en

John van Noort

Associate professor

Naam
Dr.ir. S.J.T. van Noort
Telefoon
+31 71 527 5980
E-mail
noort@physics.leidenuniv.nl

`

Meer informatie over John van Noort

Onderzoekspagina

Associate professor

  • Wiskunde en Natuurwetenschappen
  • Leids Instituut Onderzoek Natuurkunde
  • LION - Biological & Soft Matter

Werkadres

Huygens Laboratorium
Niels Bohrweg 2
2333 CA Leiden
Kamernummer CO0525

Contact

  • Eslami Mossallam B., Schiessel H. & Noort S.J.T. van (2016), Nucleosome dynamics: Sequence matters, Advances in Colloid and Interface Science 232: 101-113.artikel in tijdschrift (refereed)
  • Eslami-Mossallam B., Schram R.D., Tompitak M., Noort S.J.T. van & Schiessel H. (2016), Multiplexing genetic and nucleosome positioning codes: A computational approach, PloS one 11(6): 0156905.artikel in tijdschrift (refereed)
  • Noort J. van (9 december 2015), Unravelling the structure of single chromatin fibers (Lezing). Singapore.overig
  • Noort J. van (4 december 2015), Unravelling the structure of single chromatin fibers (Lezing). Singapore.overig
  • Noort J. van (19 november 2015), Unravelling the structure of single chromatin fibers (Lezing). Leiden, the Netherlands.overig
  • Noort J. van (17 november 2015), Molecular mechanisms of epi-genetics (Lezing). Amersfoort, the Netherlands.overig
  • Noort J. van (8 juli 2015), Pulling and twisting biomolecules (Lezing). Leiden, the Netherlands.overig
  • Noort J. van (1 juni 2015), Lna toeholds for extracting specific chromatin fragments (Lezing). Utrecht, the Netherlands.overig
  • Noort J. van (17 maart 2015), Physics of the epi-genome (Lezing). Courchevelle, France.overig
  • Noort J. van (19 februari 2015), Single molecule experiments on glucocorticoid receptor search for response elements (Lezing). Delft, the Netherlands.overig
  • Noort J. van (6 februari 2015), Unraveling the structure of chromatin with single-molecule biophysical techniques (Lezing). Gettysburg, USA.overig
  • Noort J. van (2 februari 2015), Single molecule techniques for unraveling chromatin structure (Lezing). Leiden, the Netherlands.overig
  • Noort J. van (27 januari 2015), Unraveling chromatin structure, one molecule at a time. (Lezing). Singapore.overig
  • Meng H., Andresen K. & Noort J. van (2015), Quantitative analysis of single-molecule force spectroscopy on folded chromatin fibers, Nucleic Acids Research 43: 3578-3590.artikel in tijdschrift (refereed)
  • Buning R., Kropff W., Martens K. & Noort J. van (2015), spFRET reveals changes in nucleosome breathing by neighboring nucleosomes, Journal of Physics : Condensed Matter 27 (6)(064103).artikel in tijdschrift (refereed)
  • Noort J. van (2015), werkgemeenschap commissie Fysica van Leven, FOM, (FOM). [overig]overig
  • Noort J. van (2015), Curriculum Committee Physics, Leiden Institute of Physics. [overig]overig
  • Noort J. van (2015), Study group Nucleic Acids, NWO Chemical Sciences. [overig]overig
  • Noort J. van (2015), Educational Committee Physics, Leiden Institute of Physics. [overig]overig
  • Noort J. van (2015), Co-organizer of the 'Physics Cafe', Leiden Institute of Physics. [overig]overig
  • Noort J. van (2015), Editor BMC Biophysics Redactielid BMC Biophysics .tijdschriftredactie
  • Noort J. van (2015), Editor Nature Scientific Reports Redactielid Nature Scientific Reports .tijdschriftredactie
  • Noort S & J.T. van (5 augustus 2014), A Quantitative Understanding of Chromatin Unfolding (Lezing). Telluride, USA.overig
  • Noort J. van (3 februari 2014), Single Molecule Biophysics of Chromatin (Lezing). Crans-Montana, Switzerland.overig
  • Meng H., Bosman J., Heijden T. van der & Noort S.J.T. van (2014), Coexistence of Twisted, Plectonemic, and Melted DNA in Small Topological Domains, Biophysical Journal 106(5): 1174-1181.artikel in tijdschrift (refereed)
  • North J. A., Simon M., Ferdinand M.B., Shoffner M.A., Picking J.W., Howard C.J., Mooney A.M., Noort S.J.T. van, Poirier M.G. & Ottesen J.J. (2014), Histone H3 phosphorylation near the nucleosome dyad alters chromatin structure, Nucleic Acids Research 42(8): 4922-4933.artikel in tijdschrift (refereed)
  • Buning R., Kropff W., Martens C.L.G. & Noort S.J.T. van (2014), spFRET reveals changes in nucleosome breathing by neighboring nucleosomes, Journal of Physics : Condensed Matter .artikel in tijdschrift (refereed)
  • Noort S.J.T. van (2014), Nature Scientific Reports Redactielid Nature Scientific Reports .tijdschriftredactie
  • Noort S.J.T. van (2014), BMC Biophysics Redactielid BMC Biophysics .tijdschriftredactie
  • Broek B. van den, Ashcroft B.A., Oosterkamp T.H. & Noort S.J.T. van (2013), Parallel nanometric 3D tracking of intracellular gold nanorods using multifocal two-photon microscopy, Nano Letters 13: 980-986.artikel in tijdschrift (refereed)
  • Driessen R.P.C., Meng H., Suresh G., Shahapure R., Lanzani G., Priyakumar U.D., White M.F., Schiessel H., Noort S.J.T. van & Dame R.T. (2013), Crenarchaeal chromatin proteins Cren7 and Sul7 compact DNA by inducing rigid bends, Nucleic Acids Research 41: 196-205.artikel in tijdschrift (refereed)
  • Broek B. van den, Ashcroft B., Oosterkamp T.H. & Noort S.J.T. van (2013), Parallel Nanometric 3D Tracking of Intracellular Gold Nanorods Using Multifocal Two-Photon Microscopy, Nano Letters 13: 980-986.artikel in tijdschrift (refereed)
  • Noort S.J.T. van (2013), Redactielid BMC Biophysics.tijdschriftredactie
  • Noort S.J.T. van (2013), Redactielid Nature Scientific Reports.tijdschriftredactie
  • Noort S.J.T. van (2013), Redactielid TheScientificWorldJournal.tijdschriftredactie
  • Heijden T. van der, Vugt J.F.A. van, Logie C. & Noort S.J.T. van (2012), Sequence-based prediction of single nucleosome positioning and genome-wide nucleosome occupancy, Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America 109(38): E2514-E2522.artikel in tijdschrift (refereed)
  • Driessen R.P.C., Meng H., Suresh G., Shahapure R., Lanzani G., Priyakumar U.D., White M.F., Schiessel H., Noort S.J.T. van & Dame R.TH. (2012), Crenarchaeal chromatin proteins Cren7 and Sul7 compact DNA by inducing rigid bends, Nucleic Acids Research.artikel in tijdschrift (refereed)
  • Buning R. & Noort S.J.T. van (2010), Single-pair FRET experiments on nucleosome conformational dynamics, Biochimie 92(12): 1-13.artikel in tijdschrift (refereed)
  • Engeholm M., Jager M. de, Flaus A., Brenk R., Noort S.J.T. van & Owen-Hughes T (2009), Nucleosomes can invade DNA territories occupied by their neighbors, Natural Structural & Molecular Biology 16: 151-158.artikel in tijdschrift (refereed)
  • Koopmans W.J.A., Buning R., Schmidt Th. & Noort S.J.T. van (2009), spFRET using alternating excitation and FCS reveals progressive DNA unvwrapping in nucleosomes, Biophysical Journal 97: 195-204.artikel in tijdschrift (refereed)
  • Kruithof M.C., Chien F.-T., Routh A., Logie C., Rhodes D. & Noort S.J.T. van (2009), Single-molecule force spectroscopy reveals a highly compliant helical folding for the 30-nm chromatin fiber, Nature Structural & Molecular Biology 16: 534-540.artikel in tijdschrift (refereed)
  • Kruithof M.C. & Noort S.J.T. van (2009), Hidden Markov analysis of nucleosome unwrapping under force, Biophysical Journal 96: 3708-3715.artikel in tijdschrift (refereed)
  • Noort S.J.T. van & Jager M. de (2009), Botsende eiwitkralen leggen DNA bloot, Universitaire Nieuwsbrief 2.artikel in tijdschrift
  • Neumann H., Hancock S.M., Buning R., Routh A., Chapman L., Somers J., Owen-Hughes T, Noort S.J.T. van, Rhodes D. & Chin J.W. (2009), A method for genetically installing site-specific acetylation in recombinant histones defines the effect of h3 k56 acetylation, Molecular Cell 36: 153-163.artikel in tijdschrift (refereed)
  • Schaaf M., Koopmans W., Meckel T.M., Noort S.J.T. van, Snaar-Jagalska B.E., Schmidt Th. & Spaink H.P. (2009), Single-molecule microscopy reveals membrane microdomain organization of cells in a living vertebrate, Biophysical Journal 97: 1206-1214.artikel in tijdschrift (refereed)
  • Vugt J.F.A. van, Jager M. de, Murawska M., Brehm A., Noort S.J.T. van & Logie C. (2009), Multiple aspects of atp-dependent nucleosome translocation by rsc and mi-2 are directed by the underlying dna sequence, PLoS ONE 4: e6345.artikel in tijdschrift (refereed)
  • Chien F.-T. & Noort S.J.T. van (2009), 10 years of tension on chromatin: results fromsingle-molecule spectroscopy, Curr. Pharm. Biotechnology 10: 474-485.artikel in tijdschrift (refereed)
  • Kruithof M.C., Chien F.-T., Jager M. de & Noort S.J.T. van (2008), Sub-piconeutron dynamic force spectroscopy using magnetic tweezers, Biophysical Journal 94: 2343-2348.artikel in tijdschrift (refereed)
  • Koopmans W., Schmidt Th. & Noort S.J.T. van (2008), Nucleosome immobilization strategies for single-pair FRET microscopy, ChemPhysChem 9: 2002-2009.artikel in tijdschrift (refereed)
  • Jager M. de & Noort S.J.T. van (2007), Atomic force microscopy. In: Encyclopedia of Life Sciences: John Wiley & Sons, Ltd.. 1-10.boekdeel
  • Koopmans W., Brehm A., Logie C., Schmidt Th. & Noort S.J.T. van (2007), Single-pair FRET microscopy reveals mononucleosome dynamics, Journal of Fluoresc..artikel in tijdschrift (refereed)
  • Nanyang Technological University Visiting associate professor