Eline Bergijk studeerde Biologie aan de Universiteit Utrecht en promoveerde in 1994 aan de Universiteit Leiden.

Ze bekleedde verschillende onderzoeks-, onderwijs- en managementposities aan het Leids Universitair Medisch Centrum, waaronder opleidingscoördinator Biomedische Wetenschappen. In 2007 werd zij aangesteld als hoofd van de dienst Onderwijs- en Studentzaken van de faculteit Wiskunde en Natuurwetenschappen. 

In 2017 werd Eline Bergijk benoemd als onderwijsdirecteur van de Honours Academy. Zij is lid van het bestuur en verantwoordelijk voor de organisatie en (didactische) kwaliteit van het onderwijs dat door de Honours Academy wordt aangeboden. Zij initieert de ontwikkeling van innovatief, interdisciplinair onderwijs en stimuleert hiervoor samenwerking tussen faculteiten en met externe organisaties.