Promotie
Ecology meets human health
- S. Pinto
- Datum
- donderdag 20 november 2025
- Tijd
- Locatie
-
Academiegebouw
Rapenburg 73
2311 GJ Leiden
Promotor(en)
- Prof.dr. E. W. Steyerberg
- dr. J. A. Bogaards
- dr. E. Benincà
Samenvatting
De bacteriën in onze darmen vormen samen een complex ecosysteem dat belangrijk is voor onze gezondheid. Verstoringen in dit ecosysteem, de darmmicrobiota, worden in verband gebracht met verschillende aandoeningen. Binnen het 'Ecology meets human health' project bestudeerde ik de darmmicrobiota vanuit een ecologisch perspectief: hoe bacteriën samenleven en reageren op veranderingen. Daarbij richt ik me op de vraag hoe de samenstelling en stabiliteit van de darmmicrobiota samenhangen met gezondheid en ziekte, en hoe ecologische principes kunnen helpen om darmziekten en behandelingen beter te begrijpen en te verbeteren.
Eerst keken we naar de onderlinge interacties tussen bacteriën en de betrouwbaarheid van een veelgebruikte analysemethode. Met een computermodel simuleerden we hoe bacteriën op elkaar reageren en onder welke omstandigheden echte ecologische interacties in data terug te vinden zijn. Vervolgens analyseerden we tijdreeksen van twee personen die bijna dagelijks hun ontlasting hebben verzameld. Met de ecologische methode 'wavelet clustering' kwamen temporele patronen in de microbiota aan het licht die met traditionele methoden onzichtbaar blijven.
Daarna onderzochten we de darmmicrobiota bij patiënten met ontstekingsziekten van de darm, zoals de ziekte van Crohn en colitis ulcerosa. De samenstelling van de microbiota bleek sterk te verschillen tussen patiënten, wat laat zien dat er geen eenduidig microbieel profiel bestaat voor deze ziekten. Ook bestudeerden we de behandeling met fecale microbiota-transplantatie (FMT). Het succes daarvan hangt niet alleen af van de donorbacteriën, maar ook van hoe veerkrachtig en ontvankelijk de bestaande microbiota van de patiënt is. Deze ecologische inzichten openen mogelijk nieuwe wegen voor toekomstige zorg.
Proefschriften
Ongeveer een week na de promotie zijn proefschriften van Leidse promovendi digitaal beschikbaar via het Leids Repositorium. De proefschriften op deze site zijn vrij toegankelijk. Alleen in sommige gevallen rust er een tijdelijk embargo op een proefschrift en wordt het proefschrift pas later volledig beschikbaar gesteld.
Persvragen (alleen journalisten)
Algemene informatie
Bureau Pedel
pedel@bb.leidenuniv.nl
071 527 7211