Xinya Pan
PhD candidate / Guest
- Name
- X. Pan
- Telephone
- 071 5272727
- x.pan@biology.leidenuniv.nl
I am a PhD student in Carrion Lab and Microbial Ecology Department at NIOO-KNAW. In my project I aim to decipher endophytic microbial functions activated upon pathogen infection. I am also involved in developing bioinformatic tools and its use for the prediction of endophytic lifestyle and confirmation by mutagenesis.
PhD candidate / Guest
- IBL
- Microbial Sciences
- Pan X., Elsayed S.S., Wezel G.P. van, Raaijmakers J.M. & Carrión Bravo V.J. (2026), Disentangling the molecular mechanisms of disease suppression by endophytic Flavobacterium sp. 98, Microbiological Research 304: 1-10 (128415).
- Zdouc M.M., Blin K., Louwen N.L.L., Navarro J., Loureiro C., Bader C.D., Bailey C.B., Barra L., Booth T.J., Bozhüyük K.A.J., Cediel-Becerra J.D.D., Charlop-Powers Z., Chevrette M.G., Chooi Y.H., D'Agostino P.M., Rond T. de, Del Pup E., Duncan K.R., Gu W., Hanif N., Helfrich E.J.N., Jenner M., Katsuyama Y., Korenskaia A., Krug D., Libis V., Lund G.A., Mantri S. Morgan K.D., Owen C., Phan C.S., Philmus B., Reitz Z.L., Robinson S.L., Singh K.S., Teufel R., Tong Y., Tugizimana F., Ulanova D., Winter J.M., Aguilar C., Akiyama D.Y., Al-Salihi S.A.A., Alanjary M., Alberti F., Aleti G., Alharthi S.A., Rojo M.Y.A., Arishi A.A., Augustijn H.E., Avalon N.E., Avelar-Rivas J.A., Axt K.K., Barbieri H.B., Barbosa J.C.J., Barboza Segato L.G., Barrett S.E., Baunach M., Beemelmanns C., Beqaj D., Berger T., Bernaldo-Agüero J., Bettenbühl S.M., Bielinski V.A., Biermann F., Borges R.M., Borriss R., Breitenbach M., Bretscher K.M., Brigham M.W., Buedenbender L., Bulcock B.W., Cano-Prieto C., Capela J., Carrion V.J., Carter R.S., Castelo-Branco R., Castro-Falcón G., Chagas F.O., Charria-Girón E., Chaudhri A.A., Chaudhry V., Choi H., Choi Y., Choupannejad R., Chromy J., Donahey M.S.C., Collemare J., Connolly JA, Creamer K.E., Crüsemann M., Cruz A.A., Cumsille A., Dallery J.F., Damas-Ramos L.C., Damiani T., Kruijff M. de, Martín B.D., Sala G.D., Dillen J., Doering D.T., Dommaraju S.R., Durusu S., Egbert S., Ellerhorst M., Faussurier B., Fetter A., Feuermann M., Fewer D.P., Foldi J., Frediansyah A., Garza E.A., Gavriilidou A., Gentile A., Gerke J., Gerstmans H., Gomez-Escribano J.P., González-Salazar L.A., Grayson N.E., Greco C., Gomez J.E.G., Guerra S., Flores S.G., Gurevich A., Gutiérrez-García K., Hart L., Haslinger K., He B., Hebra T., Hemmann J.L., Hindra H., Höing L., Holland D.C., Holme J.E., Horch T., Hrab P., Hu J., Huynh T.H., Hwang J.Y., Iacovelli R., Iftime D., Iorio M., Jayachandran S., Jeong E., Jing J., Jung J.J., Kakumu Y., Kalkreuter E., Kang K.B., Kang S., Kim W., Kim G.J., Kim H., Kim H.U., Klapper M., Koetsier R.A., Kollten C., Kovács Á.T., Kriukova Y., Kubach N., Kunjapur A.M., Kushnareva A.K., Kust A., Lamber J., Larralde M., Larsen N.J., Launay A.P., Le N.T., Lebeer S, Lee B.T., Lee K., Lev K.L., Li S.M., Li Y.X., Licona-Cassani C., Lien A., Liu J., Lopez J.AV., Machushynets N.V., Macias M.I., Mahmud T., Maleckis M., Martinez-Martinez A.M, Mast Y., Maximo M.F., McBride C.M., McLellan R.M., Bhatt K.M., Melkonian C., Merrild A., Metsä-Ketelä M., Mitchell D.A., Müller A.V., Nguyen G.S, Nguyen H.T., Niedermeyer T.H.J., O'Hare J.H., Ossowicki A., Ostash B.O., Otani H., Padva L., Paliyal S., Pan X., Panghal M., Parade D.S., Park J., Parra J., Rubio M.P., Pham H.T., Pidot S.J., Piel J., Pourmohsenin B., Rakhmanov M., Ramesh S., Rasmussen M.H., Rego A., Reher R., Rice A.J., Rigolet A., Romero-Otero A., Rosas-Becerra L.R., Rosiles P.Y., Rutz A., Ryu B., Sahadeo L.A., Saldanha M., Salvi L., Sánchez-Carvajal E., Santos-Medellin C, Sbaraini N., Schoellhorn S.M., Schumm C., Sehnal L, Selem N., Shah A.D., Shishido T.K., Sieber S., Silviani V., Singh G., Singh H., Sokolova N., Sonnenschein E.C., Sosio M., Sowa S.T., Steffen K., Stegmann E., Streiff A.B., Strüder A., Surup F., Svenningsen T., Sweeney D., Szenei J., Tagirdzhanov A., Tan B., Tarnowski M.J., Terlouw B.R., Rey T., Thome N.U., Torres Ortega L.R., Tørring T., Trindade M., Truman A.W., Tvilum M., Udwary D.W., Ulbricht C., Vader L., Wezel G.P. van, Walmsley M., Warnasinghe R., Weddeling H.G., Weir A.N.M., Williams K., Williams S.E., Witte T.E., Rocca S.M.W., Yamada K., Yang D., Yang D, Yu J., Zhou Z., Ziemert N., Zimmer L., Zimmermann A., Zimmermann C., Hooft J.J.J. van der, Linington R.G., Weber T. & Medema M.H. (2025), MIBiG 4.0: advancing biosynthetic gene cluster curation through global collaboration, Nucleic Acids Research 53(D1): D678-D690.
- Pan X., Hageman J.J., Weits D.A., Caldas L., Elsayed S.S., Bayona Maldonado L.M., Wezel G.P. van, Berendsen R.L., Carrión Bravo V.J. & Raaijmakers J.M. (2025), Hypoxia induces phenotypic and metabolic shifts in endophytic Flavobacterium sp. 98, The ISME Journal 19(1): wraf269.
- Zdouc M.M., Blin K., Louwen N.L.L., Navarro J., Loureiro C., Bader C.D., Bailey C.B., Barra L., Booth T.J., Bozhüyük K.A.J., Cediel-Becerra J.D.D., Charlop-Powers Z., Chevrette M.G., Chooi Y.H., D'Agostino P.M., Rond T. de, Del Pup E., Duncan K.R., Gu W., Hanif N., Helfrich E.J.N., Jenner M., Katsuyama Y., Korenskaia A., Krug D., Libis V., Lund G.A., Mantri S., Morgan K.D., Owen C., Phan C.S., Philmus B., Reitz Z.L., Robinson S.L., Singh K.S., Teufel R., Tong Y., Tugizimana F., Ulanova D., Winter J.M., Aguilar C., Akiyama D.Y., Al-Salihi S.A.A., Alanjary M., Alberti F., Aleti G., Alharthi S.A., Rojo M.Y.A., Arishi A.A., Augustijn H.E., Avalon N.E., Avelar-Rivas J.A., Axt K.K., Barbieri H.B., Barbosa J.C.J., Barboza Segato L.G., Barrett S.E., Baunach M., Beemelmanns C., Beqaj D., Berger T., Bernaldo-Agüero J., Bettenbühl S.M., Bielinski V.A., Biermann F., Borges R.M., Borriss R., Breitenbach M., Bretscher K.M., Brigham M.W., Buedenbender L., Bulcock B.W., Cano-Prieto C., Capela J., Carrion V.J., Carter R.S., Castelo-Branco R., Castro-Falcón G., Chagas F.O., Charria-Girón E., Chaudhri A.A., Chaudhry V., Choi H., Choi Y., Choupannejad R., Chromy J., Donahey M.S.C., Collemare J., Connolly J.A., Creamer K.E., Crüsemann M., Cruz A.A., Cumsille A., Dallery J.F., Damas-Ramos L.C., Damiani T., de Kruijff M., Martín B.D., Sala G.D., Dillen J., Doering D.T., Dommaraju S.R., Durusu S., Egbert S., Ellerhorst M., Faussurier B., Fetter A., Feuermann M., Fewer D.P., Foldi J., Frediansyah A, Garza E.A., Gavriilidou A., Gentile A., Gerke J., Gerstmans H., Gomez-Escribano J.P., González-Salazar L.A., Grayson N.E., Greco C., Gomez J.E.G., Guerra S., Flores S.G., Gurevich A., Gutiérrez-García K., Hart L., Haslinger K., He B, Hebra T., Hemmann J.L., Hindra H., Höing L., Holland D.C., Holme J.E., Horch T., Hrab P., Hu J., Huynh T.H., Hwang J.Y., Iacovelli R., Iftime D., Iorio M., Jayachandran S., Jeong E., Jing J., Jung J.J., Kakumu Y., Kalkreuter E., Kang K.B., Kang S., Kim W., Kim G.J., Kim H., Kim H.U., Klapper M., Koetsier R.A., Kollten C., Kovács Á.T., Kriukova Y., Kubach N., Kunjapur A.M., Kushnareva A.K., Kust A., Lamber J., Larralde M., Larsen N.J., Launay A.P., Le N.T., Lebeer S., Lee B.T., Lee K., Lev K.L., Li S.M., Li Y.X., Licona-Cassani C., Lien A., Liu J., Lopez J.A.V., Machushynets N.V., Macias M.I., Mahmud T., Maleckis M., Martinez-Martinez A.M., Mast Y., Maximo M.F., McBride C.M., McLellan R.M., Bhatt K.M., Melkonian C., Merrild A., Metsä-Ketelä M., Mitchell D.A., Müller A.V., Nguyen G.S., Nguyen H.T., Niedermeyer T.H.J., O'Hare J.H., Ossowicki A., Ostash B.O., Otani H., Padva L., Paliyal S., Pan X., Panghal M., Parade D.S., Park J., Parra J., Rubio M.P., Pham H.T., Pidot S.J., Piel J., Pourmohsenin B., Rakhmanov M., Ramesh S., Rasmussen M.H., Rego A., Reher R., Rice A.J., Rigolet A., Romero-Otero A., Rosas-Becerra L.R., Rosiles P.Y., Rutz A., Ryu B., Sahadeo L.A., Saldanha M., Salvi L., Sánchez-Carvajal E., Santos-Medellin C., Sbaraini N., Schoellhorn SM., Schumm C., Sehnal L., Selem N., Shah A.D., Shishido T.K., Sieber S., Silviani V., Singh G., Singh H., Sokolova N., Sonnenschein E.C., Sosio M., Sowa S.T., Steffen K., Stegmann E., Streiff A.B., Strüder A., Surup F., Svenningsen T., Sweeney D., Szenei J., Tagirdzhanov A., Tan B., Tarnowski M.J., Terlouw B.R., Rey T., Thome N.U., Torres Ortega L.R., Tørring T., Trindade M., Truman A.W., Tvilum M., Udwary D.W., Ulbricht C., Vader L., Wezel G.P. van, Walmsley M., Warnasinghe R., Weddeling H.G., Weir A.N.M., Williams K., Williams S.E., Witte T.E., Rocca S.M.W., Yamada K., Yang D., Yang D., Yu J., Zhou Z., Ziemert N., Zimmer L., Zimmermann A., Zimmermann C., Hooft J.J.J. van der, Linington R.G., Weber T. & Medema M.H. (2024), MIBiG 4.0: advancing biosynthetic gene cluster curation through global collaboration, Nucleic Acids Research 52(D1): D678-D690.