Cyclic peptides are investigated as a platform to induce different orientations between various ligands.

Promotor: Prof.dr. J.G.E.M. Fraaije, Co-promotor: A. Kros

A structural investigation of coiled coil peptides used as membrane fusogens, mimicing naturally occuring coiled-coil fusion proteins. Synthetic modifications have been made to alter lipid attachment, secondary structure and to insert photoactive azobenzene moieties for active control over coiled coil…

Membrane fusion is a vital process in living organisms and is mediated by zipper-like proteins.

Despite the fact that gold nanoparticles (GNPs) are one of the most studied nanoparticles, there is still a necessity for new approaches allowing for effective protective coating to enable wider use of GNPs in biomedical applications.

The work described in this thesis focuses on the development of linear or cyclized peptide probes against protein N-methyltransferases to characterize their specific binding behavior, providing further binding details for inhibitory activity study.

.

Promotor: M. Ubbink, Co-promotor: G. Siegal

The ongoing increase in antimicrobial resistance combined with the low discovery of novel antibiotics is a serious threat to our health care.

Promotor: Prof.dr. J.G.E.M. Fraaije, Co-promotor: A. Kros

Promotor: J.G.E.M. Fraaije, Co-Promotor: A. Kros

The thesis describes the use of electron paramagnetic resonance (EPR) spectroscopy, in continuous wave and pulse modes, to address the interaction of α-Synuclein (αS) with membranes and the aggregation of αS.

This dissertation contains four works during my PhD. Different biomaterials have been designed based on coiled-coil peptides. These biomaterials have a range of applications, inclusing drug delivery, cell sorting to cell-cell fusion.

One of the main challenges in the development of an effective anti-cancer vaccine is the generation of an adequate and directed cellular immune response.

The studies presented in the work show the potential of the integrative use of biophysical data in defining the structural basis of protein interactions.

Chapter 2 describes a post-synthetic methodology to introduce a fluorescent label in highly lipophilic, Pam3Cys based conjugates.

Promotores: W. Jiskoot, F. Ossendorp

Promotor: A. Kros, Co-promotor: R.R.C.L. Olsthoorn

Promotor: Prof.dr. E.J.J. Groenen, Co-Promotor: M. Huber

Promotor: Prof.dr. J.P. Abrahams

In de zoektocht naar een vaccin tegen baarmoederhalskanker heeft bundeling van fundamentele kennis over het immuunsysteem en organische chemie al geresulteerd in een vaccin, dat nu wordt getest in klinische trials. Ondertussen wordt hard gewerkt aan een verbeterde variant.

Synthetic hydrogels that mimic the natural extracellular matrix in the biophysical and biochemical cues it provides to cells are in high demand, however the cell phenotypes as they are observed in vivo in numerous cases have yet to be attained.

De GMP-faciliteit maaktde ontwikkeling en productie van Advanced Therapy Medicinal Products (ATMP's) en chemische (peptide) synthese mogelijk.

Promotores: H.S. Overkleeft; G.A. van der Marel Co-Promotor: B.I. Florea

Promotie

According to the amyloid cascade hypothesis, accumulation of beta-amyloid (Aβ) peptides initiates the pathological cascade in Alzheimer's disease (AD).

The research described in this thesis shows that hypercholesterolemia, a well-established risk factor for atherosclerosis, can impact skin lipid pool and barrier function already at young age. In the field of atherosclerosis, we showed that the small peptide Lyp-1 can be used as a targeting molecule…

The research described in this Thesis was aimed at designing and synthesizing nature-inspired compounds as part of TB vaccine discovery.

Promotores: H.S. Overkleeft, G.A. van der Marel, Co-promotor: B.I. Florea

Een nieuwe natuurkundige techniek maakt de weg vrij om het gedrag te bestuderen van Aβ-peptide. Het is bekend dat dit eiwit een rol speelt bij Alzheimer, maar voor effectieve medicatie is het nodig om te weten wat het precies doet. Publicatie op 16 maart in Journal of Biological Physics.

Lezing

Promotie

Promotie

The aim of this thesis is to study cell-cell interactions and the development of an assay to explore and quantify the exchange of membrane compounds.

In this book liposomes are explored as delivery system for allergen-specific immunotherapy. Both cationic and anionic formulations are prepared with Bet v 1, one of the allergens in birch pollen.

Promotie

Large parts of the research described in this Thesis aims at the development of oligopeptide-masked toxins and their in situ immunoproteasome-mediated activation.

Promotie

The inverse electron demand Diels-Alder (IEDDA) pyridazine elimination emerged in 2013 as a new bioorthogonal reaction and constitutes a prime example of what is now known as dissociative bioorthogonal chemistry. The research described in this Thesis aims to develop synthetic strategies which enable…

Promotor: Prof.dr. J. Kuiper

The chemical and structural heterogeneity of toxoid vaccines makes their analysis challenging. However, detailed insights on a molecular level can be obtained by mass spectrometry.

Promotie

Lezing

‘Toegepast biomedisch onderzoek zou moeten bijdragen aan verbetering van de kwaliteit van leven van de patiënt.’ Dat is een van de stellingen bij het proefschrift van Ilse Haisma. Promotie op 28 maart. Wat opvalt in de stelling van Ilse Haisma is wat er niet staat, namelijk dat toegepast medisch onderzoek…

Lezing

Nieuwe stoffen identificeren om antibioticaresistente bacteriën te bestrijden. Onderzoekers van Leiden Universiteit en VU Amsterdam bundelen hun krachten om dit waar te maken, met een project gefinancierd door NWO’s Open Technologieprogramma (OTP). De samenwerking heeft bijna een miljoen euro toegekend…

Hersenziekten zoals de ziekte van Alzheimer gaan gepaard met opeenhopingen van eiwitten in de hersenen. Maar het verband met de ziekte is niet duidelijk. In het tijdschrift PhysChemPhys publiceren Martina Huber, Enrico Zurlo en collega's een nieuwe methode om het klonteren te volgen.

Wetenschap en maatschappij ontmoeten elkaar in de Leidse Nacht van Kunst & Kennis op 20 september. Vooraf krijgen onze topsprekers alvast een prikkelende vraag. Is er nieuws over de oorzaak van migraine en wat zijn de nieuwste behandelmethoden?

In de nabijheid van zonachtige protosterren hebben wetenschappers licht opgevangen dat afkomstig is van het giftige gas methylisocyanaat. Als bouwsteen van biologisch belangrijke moleculen vormt het mogelijk een schakel in het ontstaan van leven.