Promotor: Prof.dr. M. Ubbink

The aim of the research presented in this thesis was to develop new methods forchallenging systems in liquid-state NMR using paramagnetic effects generated by thetwo-armed probe CLaNP-5.

Multicopper oxidase, laccase, can efficiently reduce oxygen to water and are mostly used in the enzymatic biofuel cells.

Promotor: Prof.dr. M. Ubbink

Promotor: Prof.dr. M. Ubbink

The main subject of this thesis is the design and synthesis of paramagnetic molecules for protein studies with NMR and EPR spectroscopy.

Promotor: M. Ubbink, Co-promotor: G. Siegal

Met de NMR faciliteit doen we onderzoek naar de synthese van paramagnetische moleculen om kennis te vergaren over de structuur en dynamiek van eiwitten. Deze kennis kan dienen als basis voor een medicijn dat zich hecht aan een eiwit of voor de ontwikkeling van vaccins. Medicijnontwikkeling is één van…

Due to their central physiological roles in living organisms, retaining beta-glycosidases have been the subject of tremendous research efforts to examine their structure/function relation using numerous biophysical and biochemical approaches.

Protein–protein complexes are formed via transient states called encounter complexes that greatly influence the formation of the stereospecific complex.

Promotor: Prof.dr. M. Ubbink, Co-promotor: G. Siegal

Nature uses a special class of histone proteins, histone variants, to modulate the properties of chromatin at defined genomic locations.

Promotor: T.H. Oosterkamp

Promotie

Promotie

Marcellus Ubbink, hoogleraar Eiwitchemie, heeft een ECHO-subsidie van NWO ter waarde van 260 duizend euro in de wacht gesleept. Met het geld gaat hij onderzoek doen naar enzymremmers.

Het programma ‘uNMR-NL’, een project om een 1.2 GHz NMR spectrometer in Nederland te plaatsen voor chemisch onderzoek, heeft 18,5 miljoen euro ontvangen om deze grootschalige faciliteit op te zetten. Dit wordt vanmiddag in Utrecht bekend gemaakt door staatssecretaris Zijlstra van OCW en Jos Engelen,…

Promotores: Prof.dr. H.J.M. de Groot, Prof.dr. J. Matysik (Universitaet Leipzig)

Climate change is a challenge for both current and future generations. New biological resources have to be developed in order to meet the demand for energy as well as the demand for food.

Light-Harvesting Complex II (LHCII) is responsible for light absorption and excitation energy transfer in plants and photosynthetic algae, while in high light it undergoes conformational changes by which it quenches excitations to prevent photodamage.

De nieuwe Leidse paramagnetische Nuclear Magnetic Resonance (paraNMR)-faciliteit wordt op woensdag 11 september officieel geopend. De faciliteit biedt externe gebruikers, zowel nationaal als internationaal, expertise op het zeer geavanceerde terrein van paraNMR-onderzoek.

Paramagnetisme. Een nieuwe occulte praktijk? Nee. Een van de nieuwste wetenschappelijke methoden om het gedrag van eiwitten haarscherp in kaart te brengen. Marcellus Ubbink van de Universiteit Leiden krijgt ruim 3 miljoen euro van de Nederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk Onderzoek en de Universiteit…

Op 2 april is de 750 MHz NMR spetrometer verhuisd van het LMUY gebouw naar de nieuwbouw van de Science Campus.

De hele dag is met man en macht gewerkt om de 4000 kilo zware magneet van de spectrometer van de vrachtwagen af te takelen en door de gangen van de Leidse bètafaculteit te loodsen. Niet helemaal zonder gevaren want de vloeren in het gebouw zijn niet berekend op zoveel gewicht. Dankzij de nodige voorzorgsmaatregelen…

The thesis describes the use of electron paramagnetic resonance (EPR) spectroscopy, in continuous wave and pulse modes, to address the interaction of α-Synuclein (αS) with membranes and the aggregation of αS.

Speciale versterkstoffen kunnen MRI-scanners honderden malen gevoeliger maken. Leidse fysici hebben nu een methode gevonden om hun efficiëntie te toetsen. Gevoeligere MRI-scans kunnen bijvoorbeeld taaislijmziekte of Parkinson begrijpelijker maken. Publicatie op 18 januari in PCCP.

De Nationale roadmap grootschalige wetenschappelijke infrastructuur van NWO maakt de bouw of vernieuwing mogelijk van onderzoeksfaciliteiten met een internationale uitstraling. Leidse NMR onderzoeksgroepen maken deel uit van het uNMR-NL consortium dat recent bijna 18 miljoen euro subsidie heeft ontvangen.…

Promotor: Prof.dr. E.J.J. Groenen, Co-Promotor: M. Huber

Factors affecting galanthamine production in Narcissus

Phospholipase A/acyltransferase 3 (PLAAT3) and PLAAT4 are enzymes involved in the synthesis of bioactive lipids. Despite sequential and structural similarities, the two enzymes differ in activity and specificity.

In this thesis, we show how MRFM can usefully contribute to the field of condensed-matter.

Promotor: R. Verpoorte, Co-promotores: Y.H.Choi, N.R. Mustafa

Promotores: P.G.L. Klinkhamer, P.M. Brakefield, Co-Promotor: M. Bruinsma

Decentralized plug and play systems for energy production are the future picture of our society. Artificial photosynthetic systems are used for this purpose.

Promotor: G.P. van Wezel, Co-promotor: Y.H. Choi

Promotor: Prof.dr. H.J.M de Groot, Co-Promotor: A. Alia

Onderzoekers onder leiding van chemicus prof. Marcellus Ubbink hebben onlangs een onderzoek gepubliceerd in Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS) over de dynamica van een belangrijk redoxenzym. Het werk is tot stand gekomen dankzij een NWO VICI subsidie van prof. Ubbink.

Promotor: Prof.dr. G.P. van Wezel

BlaC is the β-lactamase of Mycobacterium tuberculosis. We show that it can recover from inhibition by clavulanic acid and that phosphate helps it do so.

Een nieuwe NMR-microscoop geeft natuurkundigen een verbeterd instrument om fundamentele fysische processen te onderzoeken. Het biedt ook nieuwe mogelijkheden voor de medische wetenschap, bijvoorbeeld om eiwitten beter te bestuderen in de hersenen van Alzheimerpatiënten. Publicatie in Physical Review…

A difficulty of studies on chemical kinetics are the reaction time scales and detection of their intermediates.

De keten die patiënten voorziet van nieuwe medicijnen, bestaat uit diverse complexe schakels: van fundamentele wetenschap, tot klinische tests, tot productie. Deze hele keten is aanwezig in Leiden. De Universiteit Leiden, het Leids Universitair Medisch Centrum (LUMC) en de bedrijven op het Leiden Bio…

The studies presented in the work show the potential of the integrative use of biophysical data in defining the structural basis of protein interactions.

Om brandstof uit zonlicht te maken zijn twee dingen nodig: een antenne die licht opvangt, en een licht-aangedreven katalysator. De efficiëntste antennes hebben bacteriën. Een internationaal team onder leiding van Huub de Groot maakte ze na en ontdekte hoe ze in elkaar zitten.

Dr. Bela Bode ontvangt van de Alexander von Humboldt-stichting de Feodor Lynen onderzoeksbeurs voor de ontwikkeling van nieuwe methoden voor verbetering van het signaal in de vaste stof NMR. Hij streeft naar een specifiek analytisch instrument voor oppervlakte-studies en onderzoek over membranen en…

The challenge of achieving fast quantification in metabolomics is the presence of severe matrix effects during the MS analysis of complex samples.

Anthe Janssen studeerde ‘summa cum laude’ af voor de masteropleiding Chemistry. Hij gebruikte NMR methoden om inzicht te krijgen in de synthese en het gedrag van bio suiker.