Promotor: Prof.dr. T. Schmidt, Co-Promotor: S.J.T. van Noort

The studies presented in the work show the potential of the integrative use of biophysical data in defining the structural basis of protein interactions.

In human cells, a meter-long DNA is condensed inside a micrometer-sized cell nucleus. Simultaneously, the genetic code must remain accessible for its replication and transcription to functional proteins.

DNA carries various forms of information. Out of these forms of information the most well-known is classical genetic information.

The genetic information of all living organisms is contained in their DNA. Cells modify the degree of DNA compaction by epigenetics, which largely determines what genes are read out and which genes are transcriptionally silent.

Leidse theoretisch fysici hebben bewezen dat niet alleen de genetische informatie in DNA bepaalt wie we zijn, maar ook de mechanica van DNA. Helmut Schiessel en zijn onderzoeksgroep simuleerden vele DNA-sequenties en vonden een correlatie tussen mechanische kenmerken en de manier waarop DNA is opgevouwen.…

Nature uses a special class of histone proteins, histone variants, to modulate the properties of chromatin at defined genomic locations.

Promotor: T. Schmidt, Co-promotor: S. J.T. van Noort

Theoretisch natuurkundige Helmut Schiessel ontvangt een NWO Projectruimte subsidie van 390.000 euro. Met dit budget kan hij een postdoc en een promovendus aanstellen om zijn onderzoek voort te zetten naar flexibiliteit van dubbele DNA helices.

De manier waarop DNA zich opvouwt, bepaalt in grote mate welke genen uitgelezen worden. John van Noort en zijn groep hebben gekwantificeerd hoe gemakkelijk opgerolde stukjes DNA op elkaar stapelen. Dat kost minder energie dan eerder werd aangenomen. Publicatie in Biophysical Journal.

Promotie

Eencellige organismen hebben stijver DNA dan meercellige levensvormen zoals mensen en rijst. Theoretisch natuurkundigen komen tot deze conclusie na simulatie van buiging in volledige genomen. Publicatie in Biophysical Journal op 7 februari.

Promotie

De Leidse natuurkundige Maarten Kruithof heeft ontdekt hoe ons DNA zich telkens weer feilloos weet op te vouwen en ook weer weet te ontvouwen. In zijn proefschrift toonde hij aan dat het DNA opgevouwen wordt in één lange, zeer flexibele spiraalvorm.

Lezing

Lezing

Lezing