Optical projection tomography (OPT) is a tomographic 3D imaging technique used for specimens in the millimetre scale.

Promotor: K.J. Batenburg

In this thesis we present several methods to automate tomographic reconstruction algorithms and several novel tomographic reconstruction algorithms with the focus on being easily applicable and efficient to use.

Promotor: Prof.dr. K.J. Batenburg

Tomography is a powerful technique to non-destructively determine the interior structure of an object.Usually, a series of projection images (e.g.\ X-ray images) is acquired from a range of different positions.

Promotor: J.P. Abrahams, Co-promotor: T. Grüne

We have studied shape with a particular focus on the zebrafish model system. The shape is an essential appearance of the phenotype of a biological specimen and it can be used to read out a current state or response or to study gene expression.

A new type of tripodal squaramide-based supramolecular hydrogels is developed and studied.

Promotor: R. Tijdeman, Co-promotor: H.J.J. te Riele

This thesis mainly focuses on cross-modal retrieval and single-modal image retrieval via deep learning methods, i.e. by using deep convolutional neural networks.

Traditional drug discovery approaches have been hampered by (in vitro) cell-culture models that poorly represent the situation in the human body.

Promotor: K.J. Batenburg, Co-promotor: A.W. van der Vaart, B. de Smit

There is an urgent need for more physiologically relevant cell culture methods to guide compound selection in pre-clinical stages of the drug development pipeline.

Promotores: T.H.W. Bäck, A. Plaat, Co-promotor: F.J. Verbeek

Promotor: Prof.dr. B. van de Water

Promotores: K.J. Batenburg, B. Koren

Promotor: S.J. Edixhoven, Co-promotor: K.J. Batenburg

Vier Leidse studenten die de masterspecialisatie Science Based Business volgen, bedachten een concept om met een 3D Bioprinter menselijke huid te produceren. Slachtoffers van brandwonden zouden dankzij Skinprint minder operaties nodig hebben en er minder littekens aan over houden.

Rachel Schats is Assistant Professor in Human Osteoarchaeology in the Faculty of Archaeology, Leiden University.

De jaarlijkse LION Image award gaat naar de foto van een 30 micrometer lang 3D-geprint bootje dat in oktober viraal ging, ingediend door Rachel Doherty van de groep van Daniela Kraft.

Sander Blok heeft de derde editie gewonnen van de jaarlijkse LION Image Award. Hij maakte een kleurrijke afbeelding van gouden nanodeeltjes met een lage-energie elektronenmicroscoop.

Vanaf een lanceerinstallatie in Frans Guyana gaat op 19 december de Europese satelliet Gaia de ruimte in om een zeer gedetailleerde driedimensionale kaart van het Melkwegstelsel maken. De Leidse astronoom Anthony Brown leidt het consortium dat de vloed aan meetgegevens gaat verwerken.

Promotie

De plaat Electronic Escher, een kleurige psychedelische weergave van de elektronische structruur van grafeen, is de winnaar geworden van de LION Image Award 2019. Gefeliciteerd, Vera Janssen en Tobias de Jong.

Mazène Hochane en Xueying Fan hebben samen de vierde editie gewonnen van de jaarlijkse LION Image Award. Ze maakten een gedetailleerde kleurenfoto van een nier in ontwikkeling.

This thesis focuses on two processes involved in fighting infections: metabolism and immune cell motility and navigation.

Promotor: B. van de Water, Co-promotor: E.H.J. Danen

Live meekijken met een CT-scan in plaats van achteraf de beelden pas te analyseren. Als het aan de Leidse wiskundige Jan-Willem Buurlage ligt, is dat binnenkort realiteit. Hij ontwikkelt methodes om de algoritmes achter 3D-scans sneller te maken. Best een uitdaging: ‘Net als wiskundigen zijn computers…

This dissertation is an experimental study of laser-generated, atmospheric pressure, transient toroidal helium plasmas.

Promotores: Prof.dr. J.N. Kok, Prof.dr. C.A. Mandemakers, Co-Promotor: G. Bloothooft

Promotor: T. Schmidt

Promotor: B.van de Water, Co-promotor: L.S.Price

De onderzoeksgroep Digital Archaeology beheert twee computerlaboratoria voor verschillende doeleinden: een onderwijslab en een onderzoekslab.

This thesis develops statistical methods for the analysis of high dimensional data: high dimensional networks reconstruction (Chapters 1-4), incorporation of prior information in networks reconstruction (Chapters 2-4), incorporation of prior knowledge in genetic association studies (Chapter 3).

Promotie

With the dramatic growth of the image data on the web, there is an increasing demand of the algorithms capable of understanding the visual information automatically.

Promotie

Promotor: Prof.dr. M. Schilthuizen

Promotie

Promotie

In this thesis, we use low-frequency and high-frequency radio observations to address the following questions regarding quasars: is the radio loud/quiet quasar dichotomy real?

The long-held desire - to link structure directly to function and to explain molecular mechanisms based on basic chemical or physical principles - is finally coming closer, satisfying not only our scientific curiosity but also offering new solutions to the many challenges in the field of health, energy…

In this thesis, I targeted the orchid genus Lepanthes, one of the six genera of angiosperms that surpasses 1,000 species in the Neotropics, as a study model to investigate the evolutionary processes that promoted species diversifications.

Pharmaceutical companies, governments and the general public have become increasingly aware that animal models used in drug testing lack vital aspects to serve as an accurate representation of human biology. As models of the human body should become more physiologically relevant, animal models no longer…

Promotor: Prof.dr. V. Icke, Co-Promotor: T.I. Madura

Startende leraren hebben begeleiding nodig om uitval uit het beroep te voorkomen. Begeleiders van startende leraren ontwikkelen in een professionele leergemeenschap begeleidingstrajecten (inductieprogramma’s) voor startende leraren van hun eigen school.

Special Issue in: Visual Anthropology, Volume 29, Issue 3, 2016

Promotie