Promotores: J.N. Kok, H.J. Hoogeboom

Onze DNA-moleculen worden door eiwitten verpakt in compacte structuren. Het doel van dit project is om te begrijpen hoe moderne technieken voor genbewerking desalniettemin toegang krijgen tot hun doelwit op het DNA.

The type-IV secretion system (T4SS) is a machinery able to transfer DNA and proteins between bacteria and in certain cases also to eukaryotic cells.

DNA-onderzoek is veel minder hard dan altijd werd gedacht, zo blijkt uit artikelen in het Forensic Science International: Genetics en het Nederlands Juristenblad.

Promotor: R.D. Gill, F. Taroni

Promotor: D. Bouwmeester, Co-promotor: D. Kraft

Migratie is diep verankerd in het DNA van Amsterdam.

The genetic information of all living organisms is contained in their DNA. Cells modify the degree of DNA compaction by epigenetics, which largely determines what genes are read out and which genes are transcriptionally silent.

Hoe kun je tumorcellen zo effectief mogelijk uitschakelen? Het DNA-reparatiemechanisme lijkt een belangrijk mechanisme om de effectiviteit van de bestrijding van kankercellen met chemotherapie te vergroten. Om dit mechanisme te beïnvloeden is fundamentele kennis over de werking van het DNA-reparatiemechanisme…

Bacteria often experience external challenges, such as changes in environmental conditions or attacks by bacteriophages.

Promotor: P. J. J. Hooykaas Co-promotor: B. S de Pater

All life on earth contains DNA, which is used to store biological information. Organisms compact their DNA in order for it to fit inside their cell(s).

Inactivating mutations in BRCA1 or BRCA2 genes predispose to several types of cancer.

Eencellige organismen hebben stijver DNA dan meercellige levensvormen zoals mensen en rijst. Theoretisch natuurkundigen komen tot deze conclusie na simulatie van buiging in volledige genomen. Publicatie in Biophysical Journal op 7 februari.

DNA carries various forms of information. Out of these forms of information the most well-known is classical genetic information.

Sommige mensen van hoge leeftijd blijken DNA te hebben waarvan de afstelling nauwelijks verouderd is. Dat schrijven onderzoekers onder leiding van Bas Heijmans van het LUMC in het wetenschappelijke tijdschrift Genome Biology.

De Leidse natuurkundige Maarten Kruithof heeft ontdekt hoe ons DNA zich telkens weer feilloos weet op te vouwen en ook weer weet te ontvouwen. In zijn proefschrift toonde hij aan dat het DNA opgevouwen wordt in één lange, zeer flexibele spiraalvorm.

Leidse theoretisch fysici hebben bewezen dat niet alleen de genetische informatie in DNA bepaalt wie we zijn, maar ook de mechanica van DNA. Helmut Schiessel en zijn onderzoeksgroep simuleerden vele DNA-sequenties en vonden een correlatie tussen mechanische kenmerken en de manier waarop DNA is opgevouwen.…

Promovendus Willem Noteborn deed onderzoek naar supramoleculaire structuren. Die kunnen bijvoorbeeld nuttig zijn voor het laden van medicijnen of signaalmoleculen voor bijvoorbeeld cellulaire differentiatie. In zijn proefschrift beschrijft hij de werking.

De zaak Milica van Doorn, waarover de rechtbank Noord-Holland zich op 12 juni opnieuw buigt in een regiezitting, geldt als schoolvoorbeeld van wat DNA-verwantschapsonderzoek vermag. Het lijkt logisch om DNA als opsporingsmiddel vaker in te zetten bij vastgelopen politieonderzoeken naar ernstige misdrijven,…

Met behulp van statistische mechanica hebben biofysici van de Universiteit Leiden, de Stichting FOM en de Radboud Universiteit Nijmegen een model ontwikkeld waarmee meer informatie uit DNA-codes gehaald kan worden. De resultaten verschenen op 20 augustus in het gezaghebbende blad Proceedings of the…

In een Advance Online Publication in Nature Structural & Molecular Biology laten biofysicus John van Noort en anderen zien dat DNA gevouwen zit in flexibele spiralen van chromatine. De onderzoeksgroep van Van Noort ontdekte dit in nauwe samenwerking met onderzoekers uit Cambridge. Het artikel met de…

Bovenbouwleerlingen van havo en vwo moeten op school meer leren over DNA en genen, omdat die onderwerpen belangrijker zullen worden in de wetenschap. Daarom hebben universiteiten reizende DNA-labs ontworpen, waarin leerlingen onderzoek kunnen doen alsof ze wetenschappers zijn. Studenten begeleiden het…

The four possible segments A, T, C and G that link together to form DNA molecules, and with their ordering encode genetic information, are not only different in name, but also in their physical and chemical properties.

Op 17 april vieren de Reizende DNA-labs dat zij officieel de 100.000ste scholier mogen ontvangen, dit wordt uitgebreid gevierd in Wageningen. De Universiteit Leiden verzorgt sinds 2006 onder de bezielende coördinatie en leiding van Mathieu Noteborn en Patrick Voskamp (Leids Instituut voor de Chemie)…

Onderzoekers van de Universiteit Leiden en de Vrije Universiteit Amsterdam hebben bepaald hoe erfelijke informatie is georganiseerd in archaea, eencellige organismen die onder extreme omstandigheden kunnen overleven. De resultaten van het onderzoek staan in Nature Communications (27 december 2012) en…

Hoe komt het dat tegenpolen elkaar aantrekken? Volgens Karin van der Tuin, onderzoeker bij het Leids Universitair Medisch Centrum (LUMC) zou dat weleens te maken kunnen hebben met je DNA. Hoe meer dat van elkaar verschilt, hoe beter. Ze gaat haar vermoedens testen op het festival Lowlands, waar ze bezoekers…

Minister Grapperhaus van Justitie en Veiligheid wil dat bij grootschalige dna-onderzoeken materiaal kan worden afgenomen van onschuldige burgers. Is dat een wenselijke ontwikkeling?

Met de krachtigste apparatuur DNA-materiaal onderzoeken op erfelijke afwijkingen. Dat is wat GenomeScan, een bedrijf op het Leiden Bio Science Park, doet. Masterstudent Konstantina Konstantinopoulou loopt er stage. ‘Dit is heel leerzaam want de ontwikkelingen gaan razendsnel in deze wereld.’

Hoe gaan forensisch deskundigen om met complex DNA-bewijsmateriaal dat op een plaats delict wordt gevonden? Giulia Cereda ontwikkelde nieuwe statistische modellen om dit bewijs te analyseren. Promotie op 12 januari.

Door middel van DNA-restjes in het milieu de verspreiding van bedreigde dieren in kaart brengen: het Centrum voor Milieuwetenschap Leiden (CML) stuurde studenten naar de Filipijnen om een nieuwe opsporingsmethode te testen: environmental DNA. National Geographic schreef er een artikel over.

Dr. Quentin Bourgeois reageert in het NRC op ontwikkelingen in het vakgebied van archeologisch DNA.

De manier waarop DNA zich opvouwt, bepaalt in grote mate welke genen uitgelezen worden. John van Noort en zijn groep hebben gekwantificeerd hoe gemakkelijk opgerolde stukjes DNA op elkaar stapelen. Dat kost minder energie dan eerder werd aangenomen. Publicatie in Biophysical Journal.

Een schepje water door de DNA-scanner en voilà: je weet precies welke dieren en planten er in een slootje leven. Goed, zo simpel is het nu nog niet, maar volgens promovendus Kevin Beentjes (Instituut Biologie Leiden en Naturalis) kunnen we DNA-technieken nu al inzetten om de kwaliteit van zoetwater…

Een groep eencellige organismen organiseert haar DNA op een soortgelijke manier als hogere organismen als planten, dieren en schimmels. Toch verschilt de manier waarop opgerold DNA van de twee verwante groepen wordt afgelezen, ontdekte Bram Henneman. Hij promoveert op 5 december.

Patiënten van wie de dosering van medicatie wordt afgestemd op hun DNA, hebben 30% minder last van ernstige bijwerkingen volgens het LUMC.

Namens het Reizend DNA Lab van de Universiteit Leiden heeft Lianne Reinders van het Leids Instituut voor Chemisch Onderzoek in samenwerking met de andere aangesloten universiteiten een Amgen Foundation subsidie van 300.000 USD binnengehaald.

Professor Wil Roebroeks sprak in het BNR-nieuwsradioprogramma Wetenschap Vandaag over de vondst van een ware DNA-schatkamer in een Siberische grot.

Een ‘mysterie-eiwit’ identificeren aan de hand van aminozuurvolgorde en functie; DNA van gezonde cellen vergelijken met dat van tumorcellen en racen met behulp van wc-papier; allemaal proeven die bovenbouwleerlingen van havo en vwo uitvoeren in DNA-labs; reizende laboratoria waar leerlingen en DNA-onderzoek…

Een bacterie die zich verschuilt voor het immuunsysteem en stukjes DNA uit zijn omgeving oppikt. Het resultaat: nieuwe eigenschappen krijgen, zoals beter beschermd zijn tegen antibiotica. Gelukkig hebben we zo’n doemscenario nog niet eerder gevonden. Wel vond promovendus Renée Kapteijn de eerste aanwijzingen,…

Onderzoekers van Biomon hebben met behulp van DNA-technieken veertig verschillende soorten vissen in de Dommel gedetecteerd. De techniek is in staat meer soorten waar te nemen dan conventionele manieren van meten.

Ieder levend organisme op aarde bevat DNA, de genetische code die alle informatie over het organisme bevat. Maar is het buitenaardse leven gebaseerd op dezelfde moleculen als het leven op aarde? ‘Ieder levend organisme in het heelal heeft een genetische code nodig,’ zegt Emeritus hoogleraar Theoretische…

Het Openbaar Ministerie (OM) en het Nederlands Forensisch Instituut (NFI) willen particuliere DNA-databanken inzetten in een poging vastgelopen moordzaken op te lossen. Juridisch is dit toegestaan, verwacht Bart Custers, hoogleraar Law & Data Science bij eLaw, het centrum voor recht. Maar hij zou graag…

Het Openbaar Ministerie en het Nederlands Forensisch Instituut (NFI) willen bij de opsporing particuliere DNA-databanken inzetten, die voor stamboomonderzoek gebruikt worden. Het middel zou ingezet kunnen worden bij ernstige strafzaken die zijn vastgelopen. In het buitenland wordt deze methode al gebruikt.…

Self-assembly is an abundant process in nature and is vital to many processes in living organisms.

DNAmarkerpoint heeft als doel ecologie, evolutie en biodiversiteit beter te begrijpen door het bestuderen van modern en ancient DNA.